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La diversidad genética encontrada fue alta, pero la variedad intrapoblacional fue bastante menor, lo que señalaría una fuerte distinción entre las poblaciones. La red de haplotipos permitió detectar un conjunto limitado al Altiplano Norte, otro en el sur restringido a la región del río Pánuco, uno central en la región de Mapimí y otro septentrional-central en las zonas Saladense y Trans-Pecos. El análisis demográfico detectó una expansión en el conjunto mucho más austral, que habría ocurrido en el Pleistoceno. La estimación de los tiempos de divergencia (fig. 16) señaló que A. lechuguilla se habría producido hace 4.46 ma.
La endemicidad de anfibios y reptiles es muy alta, con 43 especies restringidas a la Sierra Madre Occidental (Canseco-Márquez et al., 2004). Ciertos taxones endémicos de esta provincia son un escarabajo , una serpiente de cascabel , el carpintero de Arizona , el mirlo azteca , la ardilla voladora sureña y la ardilla de Nayarit . Esta provincia se ubica en el oeste de México, en los estados de Sonora, Chihuahua, Sinaloa, Durango, Zacatecas, Nayarit y el norte de Jalisco, entre los 200 y 3,000 m de altitud, con la mayor parte de su superficie ubicada sobre los 2,000 m . La Sierra Madre Occidental posee unos 1,400 km de largo y en algunos sitios supera los 200 km de ancho. Un análisis de parsimonia de endemismos basado en especies de coleópteros de la familia Passalidae (Gutiérrez-Velázquez et al., 2013) llevó a detectar 3 zonas generales en la Región de Transición Mexicana.
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Según los resultados del análisis se similitud global, los autores reconocieron 2 unidades, una al norte y otra al sur, que consideraron equivalentes a los distritos de Yucatán y del Petén, respectivamente. El análisis de aves de la península de Cortés-Ramírez et al. coincide con esta división. En cuanto a las relaciones generales evidenciadas por los trazos, la Península de Yucatán aparece mucho más relacionada con Guatemala y Belice, y luego con América Central, siendo mínima la relación biótica con las Antillas. Barrera hizo un análisis biogeográfico de la Península de Yucatán, singularmente basado en especies de vertebrados, con el objeto de saber si se justificaba considerarla como una provincia biogeográfica. Al investigar la fauna de vertebrados, Barrera halló que los peces y anfibios endémicos eran pocos, siendo básicamente su fauna derivada de la de América Central, mientras que la endemicidad de los réptiles alcanzaba un 26%, mostrando las mismas afinidades. En cuanto a los mamíferos, 9 especies (17%) resultaron endémicas y 22 especies (39%) estuvieron representadas por subespecies de distribución más o menos restringida a la península.
Las 5 provincias biogeográficas más septentrionales de México —Californiana, de Baja California, de Sonora, del Desierto Chihuahuense y de Tamaulipas— se asignan a la zona Neártica. Con excepción de la provincia de Baja California, que es única de este país, el resto se extienden hacia el norte, abarcando parte de los EUA. Por este motivo, Rzedowski consideró a estas provincias como parte de la zona Xerofítica Mexicana, la cual asignó a la zona Neotropical. La increíble variedad específica y ecosistémica ubican a México entre los países megadiversos del planeta. Los patrones biogeográficos de los taxones del país también muestran una destacable complejidad.
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Según con estos autores, ciertos linajes de mamíferos peninsulares habrían comenzado a evolucionar en el Mioceno Medio al separarse la península del conjunto de naciones. A lo largo del Mioceno Tardío y el Plioceno Temprano se habrían formado semidesiertos, aislados de otros semidesiertos continentales por ingresiones marinas. A lo largo del Pleistoceno Tardío las especies peninsulares se habrían apartado en refugios. La alternancia de periodos de aislamiento y de contacto secundario por dispersión explicaría la complejidad biótica de la Península de Baja California.
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- Corresponde a taxones distribuidos en la región Neotropical, que evolucionaron en América del Sur; equivale al elemento Sudamericano de Savage .
- En el estado de Campeche, la vegetación original no se halla tan alterada como en otras unas partes del país (Flores-Villela y Gerez, 1994).
Área con bosques de pino, pino-encino y mesófilo de montaña, entre otros muchos. Luna-Vega y Llorente-Bousquets compendiaron el saber geográfico, geomorfológico, climático, florístico, faunístico y biogeográfico del parque. En el estado de Oaxaca, principalmente en las Sierras Mixteca y Norte. En la parte mucho más occidental, ubicada en el estado de Guerrero. Sustentado por la presencia de la flor de tigre , 1 encino , 1 carábido , 2 escarabajos , el lagarto-escorpión , la coqueta cresticorta , 2 ratones y el conejo de Omiltemi .
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Sustentado por la existencia de Cicindela fera (coleóptero) y Oryzomys melanotis (ratón). Ciertas especies se extienden hacia el sur, hasta las cordilleras de América Central. Algunos taxones endémicos de esta provincia son la biznaga (Coryphantha clavata subsp. stipitata), 2 mezquites (Prosopis reptans var. cinerascens y P. tamaulipana), el guayacón de bañistas , el gecko de bandas del desierto y 2 lagartijas (Sceloporus serrifer cyanogenis y S. variabilis marmoratus). La vegetación consiste de matorrales xerófilos y bosques espinosos, con agaves y cactos rebosantes (Dinerstein et al., 1995; Rzedowski, 1978). Entre los géneros de plantas predominantes están Acacia, Aloysia, Celtis, Condalia, Prosopis y Ziziphus (Katinas et al., 2004).
Sus límites varían de acuerdo con distintos autores; en América del Sur la porción Andina y la Patagonia se asignan a la región Andina, sobre todo sabiendo la distribución de numerosos taxones de plantas y animales . Esta provincia se ubica en el sur de México, Guatemala, Honduras, El Salvador y Nicaragua; básicamente corresponde a la Sierra Madre de Chiapas, desde los 500 hasta los 4,000 m de altitud . Entre los dos sistemas se sitúa la Cuenca o Depresión Central de Chiapas, que es el amplio valle del río Grijalva. Algunos taxones endémicos de esta provincia son el acahual , el zomplante , 1 gorgojo , el vencejo frentiblanco , el colibrí oaxaqueño , el colibrí cola blanca (E. policerca), el rascador sureño y el ratón pardo . Área de Protección de Flora y Fauna Nevado de Toluca (Estado de México). Tiene bosques de coníferas y de encino, pastizales y vegetación inducida.
La provincia de Tamaulipas se halla amenazada por los ranchos ganaderos y el avance industrial durante la frontera entre México y los EUA (Dinerstein et al., 1995). Comprende zonas montañosas, semidesérticas y entornos complejos desde el criterio ecológico y topográfico. Incluye praderas de alta montaña, matorral espinoso tamaulipeco y selva baja espinosa subcaducifolia. Dos especies representativas son la abelia y el viejito . Reserva de la Biosfera El Pinacate y Desierto de Altar . Tiene dentro elementos geomorfológicos únicos como cráteres, campos de lava y un escudo volcánico de reciente capacitación que en grupo le dan la unicidad al ubicación, el que fue incluido por la UNESCO en la lista de Sitios Patrimonio de la Humanidad.